ที่ตั้งของระบบบำบัดน้ำเสียอยู่บริเวณประตูระบายน้ำคลองแสนแสบ (ตอนมีนบุรี) ถนนประชาร่วมใจ แขวงแสนแสบ เขตมีนบุรี กรุงเทพมหานคร ซึ่งปัจจุบันเป็นที่ตั้งกลุ่มงานระบบควบคุมน้ำตะวันออก สำนักงานระบบควบคุมน้ำ มีขนาดพื้นที่ 5 ไร่ 3 งาน 66 ตารางวา มีลักษณะเป็นอาคารสูงจากพื้นดิน ประมาณ 22.5 ม. และใช้พื้นที่ส่วนที่เหลือสร้างเป็นสวนสาธารณะ เพื่อให้ประชาชนในพื้นที่มาใช้บริการ


                                

            1) พื้นที่อาคารบำบัดน้ำเสียเเละสำนักงานสำหรับเจ้าหน้าที่ของสำนักงานจัดการคุณภาพน้ำ
            2) พื้นที่อาคารสำนักงานสำหรับเจ้าหน้าที่ของสำนักงานระบบควบคุมน้ำและกองระบบคลอง (หน่วยงานที่ปฏิบัติการอยู่เดิมในพื้นที่ก่อสร้าง)
            3) ที่จอดรถ/ที่จอดเรือ
            4) พื้นที่ส่วนนันทนาการ

         ออกแบบพื้นที่นันทนาการตามแนวถนนโครงการ ให้ประชาชนเข้ามาออกกำลังกายและพักผ่อนหย่อนใจ โดยพื้นที่ริมคลองแสนแสบสามารถมองเห็นม่านน้ำตกของโรงควบคุมคุณภาพน้ำมีนบุรี ระยะที่ 1 ในฝั่งตรงข้าม และมีสะพานคนเดินเชื่อมต่อสองฝั่งคลองแสนแสบ